Вінницький національний медичний університет засновано в 1921 р. В 1960 р. навчальному закладу присвоєно ім'я М.І.Пирогова, в 1984 р. нагороджено орденом „Знак пошани”. З 1994 року Вінницький медінститут атестований і акредитований за IV рівнем акредитації, йому надано статус Університету. Національний статус університету набув у 2002 році, в цьому ж році нагороджений почесними грамотами Кабінету міністрів України і Верховної ради України.
В університеті високий рівень забезпеченості викладачами з науковими ступенями і званнями. Майже кожний шостий викладач вузу - доктор наук, професор. Студентів навчають 126 докторів наук і 677 кандидати наук. В ньому працюють 25 Заслужених діячів науки і техніки України, Заслужених працівники вищої школи і освіти України, 3 академіки АН вищої школи України, 12 Заслужених лікарів України, 5 Лауреатів Державної премії України.
В навчальному процесі і управлінні університетом широко впроваджені комп’ютерні технології. Функціонує 26 комп’ютерних класів, використовуються 4 канали мережі Іпtеrпеt, доступ до яких студентам, аспірантам і викладачам безкоштовний.
В університеті функціонує 12 наукових шкіл. Університет підтримує творчі зв'язки та співробітничає з медичними факультетами університетів 19 зарубіжних країн (в тому числі США, Німеччини, Франції, Англії, Росії та ін.), тісні зв'язки мають клінічні кафедри з 28 іноземними фармацевтичними фірмами. Викладачі кафедр задіяні у виконанні 62 міжнародних проектах.
Ректор університету — Мороз Василь Максимович, доктор медичних наук, професор, дійсний член Національної академії медичних наук України, голова Асоціації ректорів медичних вишів України, Герой України. Заслужений діяч науки і техніки України. Лауреат Державної премії України в галузі науки і техніки.